一、经文据《丽藏》玄奘译本，与世所习诵者异。
二、科依义疑(录者案——扶桑体具实观述：《药师琉璃光如来本愿功德经义疏》三卷，收入日本《大正藏》中)。
三、问多增文，答据《义疏》，间或遗略，时有润文;而观解表法多缺。
四、唯引他文而略疏释，引文止处，未易见者，旁加(文)字。
五、若属私意，则上冠‘案’字，以区别也。
六、案经谓此文唐疏者，指《药师本愿经疏》(隋本)，唐慧观撰。系敦煌石室所发现之佚本。
七、经文句读，据大师写本。(目次中甲一之‘一’，即内文子目之‘初’字。)
八、析疑文标点，乃后人所加。
序
《药师经析疑》，原系弘一律师遗稿。弘公圆寂后，该稿经圆拙法师整理完成，圆师并嘱余筹印。数年前余曾请慧剑居士协助付梓，但因缘未能圆满，故于中止，仅就岷市先印一千余本。慧剑居士崇仰弘一大师，其情殷诚，曾撰写《弘一大师传》流通行世，今又再印《药师经析疑》及《弘一大师文钞》，以供世人同飨，嘱余为序，故略述其因缘，以表赞喜!
菲律宾三宝颜福泉寺沙门传贯民国丙辰六十五年二月十二日叙
药师经析疑
弘一大师遗著
药师琉璃光如来本愿功德经
【问】：若依台宗，说玄义五重，今应如何分判耶?
【答】：玄义五重：(一)人法为名;(二)正法宝藏为体;(三)如来因果为宗;(四)与拔功德为用;(五)大乘方等为教相。
(一)、人法为名者。魏塘云：药师琉璃光如来是人名，本愿功德是法名，此说是也。青丘、秋篠及长谷，同以药师为喻者，此等不知从德立名。
(二)、正法宝藏为体者。正谓中正，法谓妙法，贵重为宝，句容为藏。与华严之诸法实性相，方等之实相如来藏，般若之佛母，法华之秘要之藏，涅槃之三德秘藏，金刚宝藏，同出异名。下文云：于其国中有二菩萨摩诃萨，乃至悉能持彼世尊药师琉璃光如来正法宝藏。若正法宝藏非经体者，二菩萨云何奉持耶?虽魏塘云：诸佛甚深行处为体者，今所不取。何者?诸佛言通，甚深叹行，行字是宗，处字非体。如下文云：流行之处。故行处字不正指体。
(三)、如来因果为宗者。本愿二字，是如来因;其余九字，是如来果。魏塘以愿行方便为宗，引下文证者。今谓此昧宗致。既是因果，岂非因而不该始末耶!
(四)、与拔功德为用者。此与魏塘同。彼云：此经始终，只明拔苦与乐。
大科为三：初序，二正宗，三流通。甲初序分二：初通序，二别序。今初
如是我闻。一时，薄伽梵游化诸国，至广严城，住乐音树下。与大苾刍众八千人俱，菩萨摩诃萨三万六千，及国王、大臣、婆罗门、居士、天、龙、药叉、人、非人等，无量大众，恭敬围绕，而为说法。
【问】：广严，梵语旧云毗舍离等。秋篠云：此是城名，而隋译本称为国者，误欤?
【答】：非也。国总，城别耳。《西域记》云：吠舍厘国(即是隋云毗舍离国)。周五千余里。吠舍厘城，已甚倾毁，其故基址周六七十里，宫城周四五里。
【问】：诸经列声闻众数，每云千二百五十人，今何甚多?
【答】：聚散随缘，何必一概。而经列千二百五十人者，如《南山》云：重其初故。又八千何多，如《金光明》云九万八千。
【问】：凡诸列众，何故数全耶?
【答】：《大论》释云：若过若减，皆存大数。
乙二别序三：初文殊请，二如来许，三文殊领。今丙初
尔时曼殊室利法王子，承佛威神。从座而起，偏袒一肩，右膝著地，向薄伽梵曲躬合掌。白言：“世尊!惟愿演说如是相类诸佛名号，及本大愿，殊胜功德。令诸闻者，业障消除，为欲利乐像法转时诸有情故。”
【问】：像法转时，是何义耶?
【答】：长谷云：转者，变也，恐指末法。今谓不尔。《七佛经》中，虽于此云末法之时，其后救脱章则云，于后末世像法起时。对佛灭后，虽蒙末名，实是像法。秋篠云：转者，起也。其说则是。
丙二如来许
尔时，世尊赞曼殊室利童子言：“善哉善哉!曼殊室利。汝以大悲，劝请我说诸佛名号本愿功德。为拔业障所缠有情，利益安乐像法转时诸有情故。汝今谛听，极善思惟。当为汝说。”
丙三文殊领
曼殊室利言：“唯然愿说!我等乐闻。”
甲二正宗分二：初举依正名号，二明本誓利益。今乙初
佛告曼殊室利：“东方去此过十殑伽沙等佛土，有世界名净琉璃。佛号药师琉璃光如来、应、正等觉、明行圆满、善逝、世间解、无上士、调御丈夫、天人师、佛、薄伽梵。
【问】：药师在东方者，魏塘云：震方为群动之首，甲木又发生之相，以药治病，贵乎起死回生，不当同金方肃杀之号。其说然欤?
【答】：八卦释经，起自李长者，此是一期之说，何必拘泥。有物于此，自东观之为西，自西观之在东。西观岂但生长，东观不定肃杀。故东方过十殑伽沙佛土，应云西方有世界名净琉璃;西方过十万亿佛土，应云东方有世界名曰极乐。须知诸佛有无量德，应有无量名，莫认一名而固执矣。
又诸佛各有别缘，且示方位。皆悉无不竖穷横遍，故密教五大云：大悲胎藏包合万行，且在东方生长万物之首。金刚智界显现万德，且在西方成就万物之终。此是随方布教标帜，非谓真如法界定有方面。四方四佛，亦复如是，只是标帜，非谓定位。(文)斯言得之。
【问】：前文殊请云，唯愿演说诸佛名号;世尊许云，劝请我说诸佛名号。何至于此，但约一佛?
【答】：若约《七佛经》，七岂非诸。若约今经，乃是《华严》：一身一智慧，力无畏亦然之义。故下文云：如我称扬药师如来所有功德，此是诸佛甚深行处。又云：若闻药师如来名号，此是诸佛甚深所行。须知请诸答一，理不乖背。
乙二明本誓利益二：初明依正庄严，二明种种功德。丙初明依正庄严二：初正明本愿，二明佛土及侍。丁初正明本愿三：初标，二列，三结。今戊初
曼殊室利!彼世尊药师琉璃光如来，本行菩萨道时，发十二大愿。令诸有情，所求皆得。
【问】：何谓愿耶?
【答】：愿是要求之名。又《摩诃止观》云：发愿者，誓也。若无誓愿，如牛无御，不知所趣。愿来持行，将至所在。愿有四种：(一)众生无边誓愿度，依苦谛立。(二)烦恼无边誓愿断，依集谛立。(三)法门无尽誓愿知，依道谛立。(四)佛道无上誓愿成，依灭谛立。初二愿拔众生苦集二谛苦，后二愿与众生道灭二谛乐，此四为总愿。而今佛十二，弥陀四十八等，皆是别愿。《止观辅行记》云：一切菩萨凡见诸佛，无不发于总愿、别愿。应知总，总于别;别，别于总。故彼别愿，不出四弘而缘四谛。(文)下文十二大愿中，魏塘约四谛分、不失旨矣。
案：今据魏塘直解文、列表如下。
┌依灭谛二愿┬第一愿┌佛道无上┐
│ └第二愿└誓愿成┴─┐
│ ├──生善与乐
├依道谛三愿┬第三愿┌法门无尽┬─┘
│ ├第四愿│誓愿知│
│ └第五愿└ ┘
└依苦集二谛共七愿┬初先出三苦┬第六愿┌众生无边┐
│ ├第七愿│誓愿度│
│ └第八愿└ ┴─┐灭
│ ┌烦恼无边┐ │恶
├二间明集谛─第九愿└誓愿断┘ │拔
└三重出三苦┬第十愿┌众生无边┬─┘苦
├第十一愿│誓愿度│
└第十二愿└ ┘
戊二列
第一大愿：愿我来世，得阿耨多罗三藐三菩提时。自身光明，炽然照曜无量无数无边世界。以三十二大丈夫相，八十随好，庄严其身。令一切有情，如我无异。
第二大愿：愿我来世，得菩提时。身如琉璃，内外明彻，净无瑕秽，光明广大，功德巍巍，身善安住;焰网庄严，过于日月。幽冥众生，悉蒙开晓，随意所趣，作诸事业。
【问】：儒胤云：初愿约应，次愿约报。其说然欤?
【答】：初愿约三身。光明照耀，即报身;相好严身，即应身;其所庄严，乃是法身。次愿亦尔。身下三句，应也;光下五句，报也。所净、所住，无非法身。
第三大愿：愿我来世，得菩提时。以无量无边智慧方便，令诸有情，皆得无尽所受用物;莫令众生，有所乏少。
【问】：青丘、秋篠，以第三第四愿为出世间门，而第三愿约人天乘者。其说然欤?
【答】：此说局矣。晋云：无量众生饥渴，何隔出世耶。
【问】：此愿与最后二愿何异?
【答】：长谷云：后别，此总。今谓不尔，皆是别愿。此重权实二智，后在衣食，故不同也。
第四大愿：愿我来世，得菩提时。若诸有情行邪道者，悉令安住菩提道中。若行声闻、独觉乘者;皆以大乘，而安立之。
第五大愿：愿我来世，得菩提时。若有无量无边有情，于我法中修行梵行。一切皆令得不缺戒，具三聚戒。设有毁犯，闻我名已，还得清净，不堕恶趣。
【问】：何谓还得清净?
【答】：因忏戒复，故云还得。《止观》云：大乘许悔斯罪。罪从重缘生，还从重心忏悔，可得相治。无殷重心，徒忏无益。(文)故欲至心发露，宜修药师妙忏。
第六大愿：愿我来世，得菩提时。若诸有情其身下劣，诸根不具，丑陋顽愚，盲聋喑哑，挛躄背偻，白癞癫狂，种种病苦，闻我名已，一切皆得端正黠慧，诸根完具，无诸疾苦。
【问】：第六大愿中，先列诸苦，闻我名已下，次第翻上。应如何分配耶?
【答】：：青丘云云。
案：今据青丘古迹记文，列表如下。
(意)
┌其身下劣┬丑陋 释身
│ │下劣────────────端正
│ │
│ └顽愚 释意
│下劣────────────黠慧
│
└诸根不具┬盲聋乃至白癞 释眼耳舌
│身根不具─────┐
│ ├诸根完具
├癫狂 释意根不具────────┘
│
└种种病苦 摄鼻等病────────无诸疾苦
第七大愿：愿我来世，得菩提时。若诸有情众病逼切，无救无归，无医无药，无亲无家;贫穷多苦。我之名号，一经其耳，众病悉除，身心安乐;家属资具，悉皆丰足。乃至证得无上菩提。
【问】：第七大愿中，先列诸苦，我之名号下，次第翻上。应如何分配耶?
【答】：秋篠有释。今不取。今谓云云。
案：今据《义疏》文，列表如下。
┌─众病逼切——多苦───────────众病悉除，身心安乐。
└┬无救────────┐
├无归────────┼───┬────家属丰足
├无医无药—贫────┴───┼────资具丰足
└无亲无家—穷────────┘
【问】：药师除病救苦，是其本旨。但众病悉除，足矣。云何便复证得无上菩提?
【答】：扬氏有释，今不取。今谓不尽一品无明，岂真众病悉除。以知证得菩提，是真病除。
第八大愿：愿我来世，得菩提时。若有女人，为女百恶之所逼恼，极生厌离，愿舍女身。闻我名已，一切皆得转女成男，具丈夫相。乃至证得无上菩提。
【问】：扬氏谓转女成男，为来世受男身者。其说然欤?
【答】：不尔。长谷云：今愿现世转女成男。其说则是，以符《七佛经》故。
第九大愿：愿我来世，得菩提时。令诸有情，出魔罥网，解脱一切外道缠缚。若堕种种恶见稠林，皆当引摄置于正见。渐令修习诸菩萨行，速证无上正等菩提。
【问】：渐令修习诸菩萨行，速证无上正等菩提者。秋篠释云：渐修菩萨十地之行，因中渐出四魔罥网，终至菩提究竟出离。其说然欤?
【答】：如是释者，速证之义不成。今谓三教纡曲，故云渐修;皆入圆住，故云速证。若就圆论者，此约理外七种方便，渐入圆因，谓之渐圆。当知往前作意，未免渐修;住上任运，故速证耳。
第十大愿：愿我来世，得菩提时。若诸有情，王法所录，绳缚鞭挞，系闭牢狱，或当刑戮。及余无量灾难陵辱，悲愁煎迫，身心受苦。若闻我名，以我福德，威神力故，皆得解脱一切忧苦。
第十一大愿：愿我来世，得菩提时。若诸有情，饥渴所恼，为求食故，造诸恶业。得闻我名，专念受持。我当先以上妙饮食，饱足其身。后以法味，毕竟安乐而建立之。
第十二大愿：愿我来世，得菩提时。若诸有情，贫无衣服;蚊虻寒热，昼夜逼恼。若闻我名，专念受持。如其所好，即得种种上妙衣服。亦得一切宝庄严具，华鬘涂香，鼓乐众伎，随心所玩，皆令满足。
戊三结。
曼殊室利!是为彼世尊药师琉璃光如来应正等觉，行菩萨道时，所发十二微妙上愿。
丁二明佛土及侍者：初总标，二别明，三结劝。今戊初。
复次，曼殊室利!彼世尊药师琉璃光如来行菩萨道时，所发大愿，及彼佛土功德庄严，我若一劫，若一劫余，说不能尽。
戊二别明二：初佛土，二侍者。今己初。
然彼佛土，一向清净。无有女人，亦无恶趣，及苦音声。琉璃为地，金绳界道;城阙宫阁，轩窗罗网，皆七宝成。亦如西方极乐世界功德庄严，等无差别。
【问】：秋篠谓净琉璃土为报土，其说然欤?
【答】：报土虽胜，不接凡夫。台宗以西方为同居净土。西方既尔，东方亦然。又据下文，有二菩萨次补佛处。既有补处，知同居土。
【问】：既与西方等无差别，何遣八士引导西方!
【答】：佛事门头，等无差别。随机门时，随彼所好。
己二侍者
于其国中，有二菩萨摩诃萨：一名日光遍照，二名月光遍照。是彼无量无数菩萨众之上首;悉能持彼世尊药师琉璃光如来正法宝藏。
戊三结劝。
是故曼殊室利。诸有信心善男子、善女人等，应当愿生彼佛世界。
丙二明种种功德二：初灭恶，二生善。丁初灭恶四：初悭贪，二破戒，三赞毁，四乖离。戊初悭贪二：初举过，二获益。己初举过二：初生报，二后报。今庚初。
尔时，世尊复告曼殊室利童子言：“曼殊室利!有诸众生，不识善恶，唯怀贪吝。不知布施，及施果报。愚痴无智，阙于信根。多聚财宝，勤加守护，见乞者来，其心不喜。设不获已，而行施时，如割身肉，深生痛惜。复有无量悭贪有情，积集资财，于其自身，尚不受用;何况能与父、母、妻、子、奴婢、作使，及来乞者。
庚二后报。
彼诸有情，从此命终;生饿鬼界，或傍生趣。
【问】：本译今云，饿鬼旁生，晋云地狱。应如何合会欤?
【答】：境有三品，于心亦然，此约中下品说。若晋本所云：恐就心境上品言耳。
己二获益二：初在彼忆念，二转生获益。今庚初。
由昔人间，会得暂闻药师琉璃光如来名故。今在恶趣，暂得忆念彼如来名。
庚二转生获益。
即于念时，从彼处没，还生人中。得宿命念，畏恶趣苦，不乐欲乐;好行惠施，赞叹施者;一切所有，悉无贪惜。渐次尚能以头目手足，血肉身分，施来求者;况余财物。
【问】：此获益文，如何翻上而分配耶?
【答】：青丘云云。
案：今据青丘古迹记文，列表如下。
┌─不识恶。───────────────畏恶趣苦，不乐欲乐。
│不识善，唯怀贪吝，不知布施，及施果报。好行惠施，赞叹施者。
│愚痴无智。───────────────────得宿命念。
│阙于信根。多聚财宝，勤加守护。────一切所有，悉无贪惜。
└─见乞者来，其心不喜，乃至及来乞者。渐次尚能，乃至况余财物。
