[22]无虫水：即无虫的洁净之水。
[23]咒一百八遍：烦恼有一百零八种，所以特地用一百零八遍的咒力破除一百零八种烦恼。
[24]得不退转：不退转，指所修之功德善根愈增愈进，不更退失转变。
[25]齿木：古代印度人习惯于清晨起身，就嚼一种大约手指粗的树枝木条，叫做“齿木”，木中有苦汁，可除口臭。这里是讲恭敬供食药师琉璃佛，必须清净身和口。
[26]供养形像：指以香花、灯明、饮食、资财等物供奉三宝，香花表示万行，烧香表示智观，涂香表示戒品，伎表示四摄(布施、爱语、利行、同事)。
[27]法师：指通晓佛法，又能引导众生信受奉行佛法的人。
6、恭敬佛陀、流传经宝。
尔时曼殊室利童子白佛言：世尊!我当誓於像法转时，以种种方便，令诸净信善男子、善女人等，得闻世尊药师琉璃光如来名号，乃至睡中、亦以佛名觉悟其耳。世尊：若於此经受持读诵，或复为他演说开示，若自书，若教人书，恭敬尊重，以种种华香、涂香、末香、烧香，华曼璎珞，幡盖伎乐，而为供养，以五色采、作囊盛之，扫洒净处，敷设高座、而用安处。
亦以佛名觉悟其耳：意即修行人在睡梦中亦能闻佛名号而得到觉悟。
受持读诵：即领受、忆持、阅读、背诵。分别来讲，即信力领纳叫受;念力坚持叫持;对着经文看着念叫读;不看经文，凭记忆而背出来叫诵。
开示：“开”为开发之意，即破除众生之无明，开如来藏，见实相之理。“示”为显示之意，谓惑障既除，则知见体显，法界万德显示分明，意即佛菩萨以佛教道理晓喻修行者。
末香：犹如现在所烧的檀香粉，古印度则是将檀香粉直洒在佛菩萨身上。
烧香：犹如现在线香，一枝一枝的。或盘香，一盘圈成好几圈。
璎珞：系用各种珠宝贯串起来的装饰品。
幡盖：指幢幡和宝盖。悬挂在佛菩萨像前长竿，竿柱高秀，头安宝珠，以种种彩帛装饰之，种为幢;长帛下坠者，称为幡;以宝玉装饰起来悬挂于菩萨所坐的高座上的伞盖，称为宝盖，幢幡则表示禅定。
伎乐：指用琵琶、铜钹、琴、瑟、箜篌等乐器所演奏的音乐，又歌颂赞唱佛德的佛赞，也称伎乐。
五色采作囊盛之：即用五种不同色织成采缎作成经囊，作盛放《药师经》和《药师神咒》之用。是为恭敬尊重之意。
[10]敷设高座：即设置高座，用以安放经典。
7、四大天王、供养守护。
尔时四大天王、与其眷属、及馀无量百千天众，皆诣其所，供养守护。世尊：若此经宝流行之处，有能受持，以彼世尊药师琉璃光如来本愿功德、及闻名号，当知是处无复横死，亦复不为诸恶鬼神夺其精气。设已夺者，还得如故，身心安乐。
四大天王：也称护世四天王。古代南亚次大陆的神话传说，后为佛教所沿用。称须弥山腹有四天王天。四天王天是四大天王和其眷属居住之处。须弥山的山腰有一小山，名犍陀罗山，山有四个山峰，各有一天王居住，各护一天下。中国民间欲称其为四大金刚。寺院的天王殿塑有四大天王像。东方持国天王塑像白色，怀抱琵琶;南方增长天王身青色，手持宝剑;西方广目天王身红色，右掌托宝塔，左手缠绕一条龙;北方多闻天王身绿色，右手持伞，左手握银貂。他们手中的法器都是吉祥的意义，宝剑舞动生风，琵琶协音可调，宝伞可以挡雨，龙被降服变顺，四方合起来就是风调雨顺，以保国泰民安。
经宝：意即此经为法宝。此经宝最为吉祥，所以不会有横死，及诸恶鬼神夺其精气等许多灾患。
8、诵思经典、一切皆遂
佛告曼殊室利：如是如是，如汝所说。曼殊室利：若有净信善男子善女人等，欲供养彼世尊药师琉璃光如来者，应先造立彼佛形像，敷清净座、而安处之。散种种华，烧种种香，以种种幢幡、庄严其处。七日七夜、受八分斋戒，食清净食，澡浴香洁，著清净衣，应生无垢浊心、无怒害心，於一切有情、起利益安乐、慈悲喜舍、平等之心。鼓乐歌赞，右绕佛像。复应念彼如来本愿功德，读诵此经、思惟其义，演说开示，随听乐求，一切皆遂，求长寿得长寿，求富饶得富饶，求官位得官位，求男女得男女。若复有人、忽得恶梦见诸恶相，或怪鸟来集，或於住处，百怪出现。此人若以众妙资具、恭敬供养彼世尊药师琉璃光如来者，恶梦恶相、诸不吉祥、皆悉隐没，不能为患。或有水火，刀毒悬险，恶象师子，虎狼熊罴毒蛇恶蝎，蜈蚣蚰蜒，蚊虫等怖，若能至心忆念彼佛，恭敬供养，一切怖畏、皆得解脱。若他国侵扰，盗贼反乱，忆念恭敬彼如来者，亦皆解脱。复次、曼殊室利，若有净信善男子善女人等，乃至尽形不事除天，惟当一心归佛法僧，受持禁戒，若五戒、十戒、菩萨四百戒、比丘二百五十戒、比丘尼五百戒。於所受中、或有毁犯，怖堕恶趣。若能专念彼佛名号、恭敬供养者，必定不受三恶趣生。或有女人、临当产时，受於极苦，若能至心称名礼赞、恭敬供养彼如来者，众苦皆除。所生之子，身分具足，形色端正，见者欢喜，利根聪明，安隐少病，无有非人夺其精气。
食清净食：即受用各种饮食，都得如法清净，绝对不可沾染五荤及鱼肉等。还有，既受八分斋戒，晚上就不能吃任何食物，如果过午还吃什么食物，即名为叫不清净食。
无垢浊心、无怒害心：垢浊心即垢心和浊心。垢心即是贪心;浊心即是痴心。怒害心是嗔心。贪嗔痴是烦恼中的三毒，也是佛门三忌。这里是讲没有贪、、痴三毒之心。
慈悲喜舍：即四无量心。慈是予人以快乐之心，悲是拨人痛苦之心，喜是见人离苦得乐而生庆悦之心，舍是舍弃一切，对任何人都无憎无爱，一视同仁，平等对待之心。
恶蝎：尾部有毒钩刺，有剧毒，可刺人使之中毒，故称恶蝎。
蚰蜒：生活在潮湿阴暗处，欲称草鞋虫、蓑衣虫，与蜈蚣同类。体短而微扁，灰白色。全身分十五节，每节有细长的足一对，最后一对特长，足易脱落，触角长，毒颚很大。
虻：状如绳，略大。专咬牲畜，也要叮人，有牛虻、花虻、食虫的区别。
不事馀天：即不事奉其馀诸天。就是不事奉外道天、魔王天和凡夫天，认为只有皈依三宝，依教修行，才能达到无漏的无馀涅磐。
禁戒：亦称净戒。“禁”是禁止身、口、意三恶业，“戒”是戒诸恶行。
形色：即形体与色相。如人有长短、方圆、高下、正不正等形相，可见于眼者。
利根：卽鋭利的根性。意谓眼、耳、
非人：指天龙八部、夜叉、恶鬼等等。
夺其精气：即夺去人的性命。
9、颂扬世尊、佛理教义
尔时，世尊告阿难言，如我称扬彼世尊药师琉璃光如来所有功德，此是诸佛甚深行处，难可解了、汝为信不。阿难白言，大德世尊，我於如来所说契经，不生疑惑。所以者何。一切如来，身语意业、无不清净。世尊，此日月轮、可令堕落，妙高山王、可使倾动，诸佛所言，无有异也。世尊，有诸众生，信根不具，闻说诸佛甚深行处，作是思惟，云何但念药师琉璃光如来一佛名号，便获尔所功德胜利。由此不信，返生诽谤，彼於长夜、失大利乐，堕诸恶趣，流转无穷。佛告阿难，是诸有情，若闻世尊药师琉璃光如来名号，至心受持不生疑惑，堕恶趣者，无有是处。阿难，此是诸佛甚深所行，难可信解，汝今能受，当知皆是如来威力。阿难：一切声闻、独觉、及未登地诸菩萨等，皆悉不能如实信解，惟除一生所系菩萨。阿难：人身难得，於三宝中、信敬尊重，亦难可得。闻世尊药师琉璃光如来名号，复难於是。阿难：彼药师琉璃光如来、无量菩萨行、无量善巧方便、无量广大愿，我若一劫、若一劫馀、而广说者，劫可速尽，彼佛行愿善巧方便、无有尽也。
大德：系对自觉、觉他、觉行圆满的三觉圆满者和万德具全者的尊称。佛具三觉：即本觉(一切众生本来具有的自性清净心)、始觉(外缘助薰开始觉知本有的自性)、究竟觉(发心修行，达到惑尽智圆证成佛道的究竟清净)。故称佛为大德世尊。而对菩萨、阿罗汉，有时也称大德。
契经：谓契理契机之经典。即指佛教经典。
日月轮：即日转和月轮。日轮即日宫，是日天子所居之宫殿，一般称太阳。月轮即月宫，是月天子所居之宫殿，一般称月亮。
妙高山王：指佛经上所说的须弥山。其山高大无比，为众山之王，故称为妙高王。
信根：五根之一。指信三宝、四谛。是对佛法信仰的基础或对佛法信仰的根本。
长夜：谓凡夫流转生死，无明昏暗，犹如长夜。
未登地诸菩萨：指尚未登十地位的一切菩萨。菩萨行共有五十一阶果位，由浅入深。即十信位、十住位、十行位、十回向位、十地伴及等觉菩萨位，合为五十一果位。其中十住、十行、十回向的三阶位称为三贤位。因尚未登十地、未入圣位，故称为未登地菩萨。
一生所系菩萨：即一生补处菩萨，亦称等觉菩萨。大乘阶位五十一位中最后一位之菩萨称等觉，因为是即佛位的一位补处大菩萨，是系属于一生补处的，故称一生所系菩萨。
10、皈依三宝、免堕六道。
尔时众中有一菩萨摩诃萨，名曰救脱，即从座起偏袒右肩，右膝著地，曲躬合掌、而白佛言：大德世尊，像法转时，有诸众生、为种种患之所困厄，长病赢瘦，不能饮食，喉唇乾燥，见诸方暗，死相现前，父母亲属，朋友知识，涕泣围绕。然彼自身卧在本处，见琰魔使、引其神识至於琰魔法王之前。然诸有情、有俱生神 。随其所作，若罪若福，皆具书之，尽持授与琰魔法王。尔时彼王推问其人，计算所作，随其罪福、而处断之。时彼病人，亲属知识，若能为彼皈依世尊药师琉璃光如来，请诸众僧转读此经，然七层之灯，悬五色续命神幡。或有是处、彼识得还，如在梦中，明了自见。或经七日、或二十一日、或三十五日、或四十九日，彼识还时，如从梦觉，皆自忆知善不善业、所得果报。由自证见业果报故，乃至命难、亦不造作诸恶之业。是故净信善男子、善女人等，皆应受持药师琉璃光如来名号，随力所能，恭敬供养。
尔时阿难问救脱菩萨曰，善男子，应云何恭敬供养彼世尊药师琉璃光如来，续命幡灯、复云何造。救脱菩萨言，大德，若有病人、欲脱病若，当为其人、七日七夜受持八分斋戒。应以饮食、及馀资具，随力所办、供养比丘僧。昼夜六时、礼拜供养彼世尊药师琉璃光如来，读诵此经四十九遍，燃四十九灯，造彼如来形像七躯，一一像前、各置七灯，一一灯量、大如车轮，乃至四十九日光明不绝。造五色采幡，长四十九搩手，应放杂类众生、至四十九。可得过度危厄之难，不为诸横恶鬼所持。
救脱：菩萨名。此菩萨以救人病苦、脱离灾难而得名。身呈红色，坐莲花座，右手执持妙法藏供养，左拳按胯。
死相：即人临死时显示出来的种种外相，如瞳孔散大，体温渐降，呼吸缓慢，只呼不吸，心跳微弱，脉象似停，人气将断，神识欲去。
琰魔使：“琰魔”即琰魔法王，又名阎摩王，即民间俗称的阎罗王。是冥界之王，对善恶赏罚、祸福升降法中有操纵权，故名法王。“琰魔使”，即琰魔法王的使卒，欲称鬼差、无常等等，又叫勾魂使，名目繁多。
神识：即一般世间所说之灵魂。
俱生神：即与生俱来的神。佛经载，此神常骑在人之双肩，在人死后即向阎摩王报告该人之出生与善恶。有男女二神：女神名同生，通常坐于人之右肩，记录该人所作之恶事;男神名同名，通常坐于人之左肩，记录该人所作之善事。
七层之灯：为对治身三口四之七支恶业而燃点之七层智慧明灯。恶业有七支，身三(杀生、偷盗、邪淫)，口四(妄语、绮语、两舌、恶口)。七层智慧明灯照出七菩提路，以防止七恶业，故称七层之灯。
五色续命神幡：“续命神幡”，又作“寿命幡”。乃延寿祈命之神幡。此幡有五种颜色，即青、黄、赤、白、黑，故名五色续命神幡。
六时：古印度将一日一夜分为昼三时和夜三时，合计六时。昼三时为早晨、中日、日没;夜三时为初夜、中夜、后夜。
搩手：亦称磔手。(音哲)手，即张开手指，从大拇指端到中指端的距离叫一搩手。中国欲称“一虎口”。古代印度多以搩手量物，中国民间木工也有用此以估计长度的。
放杂类众生：即佛教所说的放生。“杂类”指家禽、家畜、水族、爬虫之类。放生就是解脱这些生物的灾难，使之延长生命，由此可获得消灾延寿的功德。
诸横：谓一切横死的简称。横死指非因往世之业果致死，而系遭受意外灾祸而死亡的。如得病无医、王法诛戮、非人(恶鬼、夜叉等)夺精气、火焚、水溺、恶兽啖、坠崖、毒药咒诅、饥渴所困等，均属于横死。现代的车祸、飞机失事等，也属于横死。
