『愿我来世得菩提时。身如琉璃。内外明彻。净无瑕秽。』第二愿是唯药师佛独有的。他得菩提成佛时，身有三身佛，随类变化，或现人天，或现鬼畜，无有定相。身如琉璃之身，此变化身，如青色宝，内外明彻，净无瑕秽，晶莹剔透。
炎帝和神农的身体也是透明的，内外明澈，一览无余，吃下去的药怎么行走，在哪一条经脉上能起到什么作用，看得非常清楚。炎帝和神农研制了很多的草药。如果把炎帝比喻成药师佛可不可以呢?也可以!他俩是一个人，但是他俩又不是一个人，从身体性能上，他俩都有这种功能，但他俩不是一个，神农是药王菩萨或药上菩萨，但不是佛。
内外明澈没有障碍，如果大家修行修到这种地步，X光可以不用了，有病自己来看，一看哪根经脉堵住了，拿针扎一下穴位，经脉就通了。
大家要明了，自己修到最好最圆满的时候，就能知道自己得了什么病。如果你会开一些药方，自己的病轻而易举地就会把它处理掉了。佛法里讲五明，掌握了医方明，用佛法度化众生就比较方便。如果没有技能，也就没有机缘给别人讲佛法。算命也是好事，但看心放在哪儿，如果放在赚黑心钱上就成问题。把算命当作一种方便的法门，以这种方式来教化众生，让他们学佛信佛这是好事。所以很多世间的东西看的是心和愿。心正运用的方法就是正的;心邪方法再好也是邪的。
『光明广大。功德巍(wēi)巍。身善安住。焰网庄严。过于日月。』老子是神龙见首不见尾，楞严咒里有无见顶相，看佛的时候看不到边。这里形容药师佛的光明广大，照耀无量无际的空间，让人们安住在祥和、喜乐的境界中，其功德巍巍。
我们所居住的世界，以日、月、星为三光，尤以日月之光为大，但药师佛散发的光芒超过了日月之光。其散发的光芒交织在一起非常绚丽庄严，这样的光芒能摄受众生，不敢心生杂念。民间有一句话：萤火之光怎敢和皓月相提并论。可见佛光的威力非同寻常。
『幽冥众生。悉蒙开晓。随意所趣。作诸事业。』幽冥有两种说法，一种说法是地狱里的众生，由地藏菩萨管理的;另外一种是老见不着阳光的众生，白天隐没，黑暗出来，像很多动物就是幽冥众生，或者说太阳永远照不到的地方也叫幽冥。太阳北回归的时候，南极有半年是黑天，太阳回归南极的时候，北极有半年是黑天，那里的生命可以称为幽冥众生。
我们地球上的日月虽能照破幽冥，但黑夜却没有日光。而药师佛的光芒能照破幽冥世界，让那里的众生蒙受药师佛的光芒，如盲人得到了眼睛，身心沐浴在光明熙和中。随众生的心愿，让众生感到乐趣与自在，随自己的乐趣来从事自己喜欢的事业。
培植德本，发扬慧力，使世界和平，人民安乐，一切作业，悉得成就。这是药师佛第二愿的实际应用，是药师佛为众生发的愿。
释迦佛说娑婆世界跟两个佛最有缘，一是药师佛代表东方，东方在《易经》里代表生气门，紫气东来呀。为什么叫紫气东来?气为生气，我们得到了东方的气体，生命力会生发，太阳也是从东方升起。二是阿弥陀佛代表西方，太阳落下的时候，表明生命之光芒烧光了，油尽灯枯了，这个时候阿弥陀佛接引我们往生极乐世界。
释迦佛讲的每部经都是圆满的，都是第一的，法法圆满，经经无碍。这就表明不仅《药师经》是最好的，《阿弥陀经》也是最好的，法法平等啊!《金刚经》里说法法平等，无有高下，都是平等的法，就看自己适合什么法，适合什么法，什么法就是第一的。我们凡夫要从第一之中挑出一部最适合自己的经文来修行。
第二个愿叫开晓事业愿。世间法和出世间法是圆融无碍的，药师佛发的愿力和众生紧密相关啊!佛的智慧能明了一切，能知晓一切。
在世间修行，行大乘心愿根本智和后得智都得具足：根本智，是每个人原本具足的，是不生不灭，不垢不净，不增不减的，根本智里包括四个智：大圆镜智、成所作智、妙观察智、平等性智。根本智也叫一切智;另外一个是后得智，是学习五明得来的。小乘佛法修到阿罗汉果位的证得了根本智，就不再去求后得智了，觉得后得智太累，就入定作自了汉。菩萨必须证得根本智之后，还要掌握五明，五明通达圆满具足了，最后才证得佛果。
我们证得根本智，还要证得后得智。根本智无所得，因为它本身就是空性的，它根本就不需要得到什么，也不需要失去什么，是不生不灭，不垢不净，不增不减。后得智无尽得，永远都学不完，只要是人，除了佛，哪怕是十地菩萨也学不完。因为无常不断的变化，所以就学不完。
后得智就是要明了世间五明。一明不明，方法善巧不够，度人就困难了。方法善巧要在五明运用中学会的。只要活着，后得智的学问就不会尽，今天研究出这个，明天又研究出那个需要学，世间法是无常的，所以说是不可能学完的。
世间是缘起性空的，任何事情都是无常的，无有自性的。大家可以用最近学来的佛法来分析一下，世间的任何东西都可以分割到最小还能分割，它没有主宰。一个石头从表面看很光滑，可在显微镜下看它，分子与分子之间窟窿非常大，分子可以分割到最小最小还可以分割下去，只要科学达到那个地步，就一直可以分割下去，这就是说世间法上的东西都是无自性的，没有一个主宰。
西方说上帝主宰一切，上帝在哪里呀?就是我们的心量，就是我们的本性，这个本性可以主宰一切，一切唯心造啊!山河大地都是我们自性当中生发出来的，是生灭变化的，是虚妄不实的。
【第三大愿。愿我来世得菩提时。以无量无边智慧方便。令诸有情。皆得无尽所受用物。莫令众生有所乏少。】
第三个愿更是实在，实在到你缺什么，佛都会让你满足。你如果缺的话，那他的愿就成了虚言。所以第三个愿叫无尽资生愿，你想得到的都能得到。
愿我来世得到无上菩提的时候，用无量无边的善巧智慧方便，帮助所有的众生，只要是他们所需要的，就让他们都能得到圆满，所以药师佛发了一个最适合我们需要的愿。
释迦佛、药师佛的慈悲心量，从这里就能看出布施啊!布施般若蜜，布施心特别的大，大到只要众生需要，全都满足，全都供给。再回头看看我们自己，可不可以做到呀?
莫令众生，有所乏少，不会让众生失望的，也不会让他们缺少，绝对让他们满足。这就是药师佛发的最真诚的、最好的、最实际的、也是最适合我们现代人的一个最实际的愿。
愿大，心量大。佛的愿望让我们感觉到自己很渺小，感觉自己的心量太狭隘，跟罗汉比起来我们是小人中的小人。很多人说修小乘佛法的自了汉是小人，修大乘心愿的人是大人，那我们连罗汉都不如，罗汉还能自了，我们连自了的能力都没有，因为我们太无明了，缺乏智慧啊!
五明：因明，声明，医方明，工巧明，内明。除了内明为佛学外，其余四明都是济世利人的方便之用。五明是要学习的，五明懂了之后，方可以去度人。很多人说不明白五明，也可以去度人?当然是可以了，但度的效果好不好?能分出高低的。在人道首先还是要明白五明，然后把自己的无明壳去掉，才能回小向大。
如今科学发明创造，物质丰富，供给人们衣食住行上种种物质享受，都是方便之用。但由于人们无明缺乏智慧，起贪嗔痴互相争夺，世界祸乱此起彼伏。如果依药师佛的智慧，用科学资生的方便，干戈停息，世界和平，人民衣食丰富，所受无缺乏啊!
以上就是妙用禅师开示药师经了，其实我们修行药师经的时候可以多看看这些讲解，是能够让我们更快的知道药师经的大意，能够让我们更好的去修行的。以上只是作者对文章的一些理解，如果有不正确的地方还望海涵。
